精液是培养液污染最可能的来源。试管公司发现38例污染中，10例污染菌种与受精的精液培养的菌种相同，直接证实污染来自精液。此外，2例真菌污染来自同一份供精标本，也提示污染来自精液。其他间接证据包括与精液接触时间短者没有污染，如ICSI没有污染，所有的38例污染均为IVF;同一患者的ICSI胚胎没有污染，而IVF形成的胚胎有污染；同一患者受精2小时的胚胎无污染或污染较轻，而与精液过夜受精的胚胎有污染。上述资料均提示精液是污染的主要来源。

精液含有细菌，大量的文献报道，无症状男性精液原液微生物培养阳性率为50%一%，50%的病例每毫升有个以上，多数为非致产。最常见的细菌有表皮葡萄球菌(63%)，绿色链球菌(28%)，大肠杆菌(9%)，金黄色葡萄球菌(5%），粪链球菌(5%)，溶血链球菌(4%)，聚团肠杆菌(4%)，其他(4%)。也有文献报道最常见的细菌为肠球菌占73%。还有文献报道最常见的为解脲支原体，其次为沙眼衣原体。同济医院对30例进行IVF男性的精液原液进行培养，阳性率为96.7%(2930)。其中前3位者为凝固酶阴性葡萄球菌，G+球菌和粪肠杆菌，其他有G杆菌、G+杆菌、大肠杆菌、铜绿假单胞菌、奇异变形菌等。（试管婴儿原创wwwnom，转载请说明出处。）

精液的污染可来自男性尿道。尿道正常菌丛有白色葡萄球菌、类白喉杆菌、非致病性分枝杆菌。精液是由附睾的精子、精囊腺、前列腺和尿道球腺的分泌物组成，虽然正常情况下每个部分都是无菌的，但是射精时精液通过尿道，可能被尿道的菌丛污染。男性尿道常有微生物寄居，如需氧菌、厌氧菌、酵母菌、生殖道支原体（解脲支原体和人型支原体），除了这些常见的菌丛外，也能见到致产和潜在致病微生物如淋球菌、沙眼衣原体、滴虫等。Cottle取男性前段、中段尿和精液进行细菌培养，细菌的阳性率分别为37%、27%和51%，大多数为尿道中常见的革兰阳性菌。Willen也证实，44%精液中发现的细菌和58%前列腺中发现的细菌与尿道的细菌相同，冠状沟中71%的细菌与尿道相同，提示精液的细菌来自男性尿道。

虽然菌精症常见，但发现的微生物很少重复，而且精液中存在的细菌与白细胞的浓度无关，这些结果均提示，精液中的细菌很大部分来自尿道寄居细菌的污染，而不是活动感染。

精液中的细菌除来自尿道外，还可能来自皮肤菌的污染。皮肤正常菌丛有葡萄球菌、类白喉杆菌、绿脓杆菌、非致病性分枝杆菌、白念珠菌、丙酸杆菌。Stovall等报道80%的精液培养至少分离出一种细菌，而最常见的4种细菌中，3种为正常皮肤菌，提示在全的过程中，手和外阴等部位的细菌可能污染精液。胚胎污染来源于精液